单细胞ATAC测序

10x Genomics的Chromium Controller是基于微流控技术的单细胞文库制备系统，可以同时获 得3000-80000以上的单细胞，制备文库和Illumina平台兼容，通过测序实现对高通量单细胞数据 进行细胞群体的分类以及细胞群体间基因表达的差异分析。10x Genomics单细胞表达分析可应用 的细胞类型众多，如肿瘤细胞、免疫细胞、干细胞、神经细胞、生殖细胞、胚胎细胞等。是研究肿瘤异质性，免疫细胞群体和胚胎发育的优秀方法。

文库制备

10x scATAC-seq基于GemCode微流体平台，首先利用转座酶混合液孵育细胞核悬液，转座酶进入细胞核，优先在切割开放染色质区域使DNA片段化，并在DNA片段的末端添加测序引物；其次，带有标签（Barcode）的凝胶珠（GelBeads）和单个细胞核包裹在油滴中，形成GEMs；随后凝胶珠溶解，细胞核裂解释放DNA片段，并在片段末端加上标签；GEMs破裂后，回收带有标签的DNA，构建文库；最后，利用Illumina测序平台对文库进行高通量测序。

信息分析流程

部分结果展示

优势总结

1.真正的单细胞测序：通过油滴-barcode-单细胞的对应关系，实现真正意义上的单细胞测序；

2.细胞捕获效率高：单个细胞捕获效率高达65%，可准确鉴别稀有细胞类型；

3.测序平台兼容度广：与Illumina各种型号的平台高度兼容；

4.性价比高：相较于其他单细胞平台，操作简单，价格优惠；

5.超高通量：单个样本细胞检测数范围1000-10000；

6.丰富的多物种多组织类型单细胞悬液制备经验；

7.提供个性化分析。